MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL54

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011315	GGC	2	6	41	46	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011315	CG	3	6	76	81	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011315	ATGT	2	8	126	133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011315	A	6	6	156	161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011315	ACA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011315	CTA	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011315	ACAA	2	8	275	282	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011315	CTTG	2	8	289	296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011315	AGT	2	6	297	302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011315	TCT	2	6	1214	1219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011315	TTA	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011315	AC	3	6	1301	1306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011315	TTCTT	2	10	1422	1431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011315	TCGCT	2	10	1589	1598	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011315	GT	3	6	1633	1638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011315	ATTGCC	2	12	2435	2446	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011315	CCA	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011315	TTC	2	6	2525	2530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011315	TGA	2	6	2632	2637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011315	T	6	6	2725	2730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011315	CTT	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011315	A	6	6	3063	3068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011315	ATT	2	6	3134	3139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011315	GCA	2	6	3361	3366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011315	TTGCC	2	10	3374	3383	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011315	CTAT	2	8	3389	3396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011315	TG	3	6	3420	3425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.